夫人去了朋友家，木熊教授回家的时候她不在，等她八点左右回家的时候，木熊教授已经外出了。木熊夫人对警方解释说：“我还以为他是去什么地方吃饭了。”至于木熊教授为什么改变计划提早回来就不得而知了，市之濑助教也说她没有问过教授原因。

据推断，木熊京介是死于16日即星期六的凌晨两点到四点之间，死因是窒息。从死者颈部也可以看到绳子勒过的痕迹，是被用力勒过才有的痕迹。凶器在尸体的另一侧，搬运室的卷门旁边发现了一根钢丝绳，和尸体身上留有的勒痕相一致，虽然上面没有留有任何可疑的指纹，但从现场情况来看并非自杀。

上午11点半左右，市之濑助教发现木熊教授尸体的时候，准备室和实验室之间的门是锁着的，而且准备室的紧急出口也是反锁着的。钥匙在木熊教授的房间里，市之濑助教就是用这把钥匙打开了准备室的门，因为她有木熊教授房间的备用钥匙。另一把钥匙在教授的上衣口袋里被发现了，事务室也有一把可以打开准备室的钥匙，但事务室是锁着的（这是前一天晚上西之园萌绘被救出后警卫锁上的）。教授房间和事务室的门窗都没有被人非法侵入的痕迹，因此凶手逃走的惟一途径就是电动卷门，但是电动卷门正对着警卫室，距离还不到10米。